Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SGSM2O43147 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGSM2O43147 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms