Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBDO15205 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBDO15205 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBDO15205 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBDO15205 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBDO15205 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBDO15205 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBDO15205 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
UBDO15205 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBDO15205 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBDO15205 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBDO15205 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBDO15205 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UBDO15205 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBDO15205 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBDO15205 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBDO15205 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBDO15205 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBDO15205 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBDO15205 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBDO15205 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBDO15205 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBDO15205 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBDO15205 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBDO15205 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBDO15205 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBDO15205 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBDO15205 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBDO15205 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBDO15205 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBDO15205 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBDO15205 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBDO15205 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
UBDO15205 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBDO15205 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBDO15205 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBDO15205 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBDO15205 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UBDO15205 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBDO15205 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBDO15205 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBDO15205 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBDO15205 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBDO15205 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBDO15205 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBDO15205 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBDO15205 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBDO15205 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBDO15205 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBDO15205 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBDO15205 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBDO15205 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBDO15205 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBDO15205 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBDO15205 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBDO15205 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBDO15205 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBDO15205 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBDO15205 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBDO15205 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBDO15205 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBDO15205 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBDO15205 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBDO15205 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBDO15205 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBDO15205 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBDO15205 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBDO15205 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBDO15205 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBDO15205 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBDO15205 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBDO15205 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBDO15205 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBDO15205 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBDO15205 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBDO15205 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBDO15205 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBDO15205 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBDO15205 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBDO15205 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBDO15205 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBDO15205 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBDO15205 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBDO15205 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBDO15205 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBDO15205 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBDO15205 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBDO15205 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBDO15205 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBDO15205 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBDO15205 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBDO15205 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBDO15205 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBDO15205 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBDO15205 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBDO15205 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBDO15205 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBDO15205 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBDO15205 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBDO15205 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms