Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD28O15084 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms