Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms