Protein–RNA interactions for Protein: O00567

NOP56, Nucleolar protein 56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56O00567 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOP56O00567 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOP56O00567 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOP56O00567 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOP56O00567 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOP56O00567 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOP56O00567 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOP56O00567 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOP56O00567 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOP56O00567 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOP56O00567 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOP56O00567 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOP56O00567 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOP56O00567 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOP56O00567 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP56O00567 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP56O00567 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP56O00567 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP56O00567 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP56O00567 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP56O00567 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP56O00567 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP56O00567 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP56O00567 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP56O00567 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP56O00567 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP56O00567 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP56O00567 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP56O00567 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP56O00567 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP56O00567 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP56O00567 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP56O00567 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP56O00567 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP56O00567 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP56O00567 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP56O00567 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP56O00567 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP56O00567 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP56O00567 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP56O00567 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP56O00567 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP56O00567 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP56O00567 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP56O00567 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP56O00567 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP56O00567 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP56O00567 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP56O00567 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP56O00567 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP56O00567 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP56O00567 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP56O00567 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP56O00567 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP56O00567 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP56O00567 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP56O00567 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP56O00567 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NOP56O00567 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NOP56O00567 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NOP56O00567 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NOP56O00567 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP56O00567 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP56O00567 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP56O00567 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP56O00567 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP56O00567 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP56O00567 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP56O00567 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP56O00567 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP56O00567 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP56O00567 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP56O00567 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP56O00567 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP56O00567 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP56O00567 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP56O00567 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms