Protein–RNA interactions for Protein: O00534

VWA5A, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5AO00534 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA5AO00534 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA5AO00534 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VWA5AO00534 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VWA5AO00534 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA5AO00534 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA5AO00534 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA5AO00534 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA5AO00534 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA5AO00534 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA5AO00534 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms