Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLRMTO00411 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLRMTO00411 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms