Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF103O00237 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF103O00237 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF103O00237 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF103O00237 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF103O00237 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF103O00237 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF103O00237 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF103O00237 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF103O00237 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF103O00237 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF103O00237 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF103O00237 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF103O00237 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF103O00237 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF103O00237 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF103O00237 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF103O00237 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF103O00237 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF103O00237 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF103O00237 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF103O00237 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF103O00237 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF103O00237 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF103O00237 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF103O00237 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF103O00237 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF103O00237 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF103O00237 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF103O00237 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF103O00237 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF103O00237 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF103O00237 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF103O00237 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF103O00237 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF103O00237 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF103O00237 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF103O00237 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF103O00237 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF103O00237 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF103O00237 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF103O00237 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF103O00237 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF103O00237 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF103O00237 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF103O00237 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF103O00237 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF103O00237 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF103O00237 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF103O00237 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF103O00237 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF103O00237 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF103O00237 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF103O00237 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF103O00237 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF103O00237 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF103O00237 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF103O00237 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF103O00237 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF103O00237 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF103O00237 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF103O00237 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF103O00237 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF103O00237 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF103O00237 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF103O00237 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF103O00237 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF103O00237 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF103O00237 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF103O00237 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF103O00237 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF103O00237 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF103O00237 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF103O00237 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF103O00237 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF103O00237 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF103O00237 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms