Protein–RNA interactions for Protein: C9J1S8

TRIM49D1, Tripartite motif-containing protein 49D, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49D1C9J1S8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM49D1C9J1S8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM49D1C9J1S8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM49D1C9J1S8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM49D1C9J1S8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM49D1C9J1S8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms