Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF879B4DU55 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms