Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1CA8MV81 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms