Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNL1A8MU46 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms