Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SOBPA7XYQ1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOBPA7XYQ1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
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