Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRM3A6NNA2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms