Protein–RNA interactions for Protein: A6NI28

ARHGAP42, Rho GTPase-activating protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP42A6NI28 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms