Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6BA6NDN3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms