Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRD1A4D1F6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms