Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSC5DA1L4H1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSC5DA1L4H1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSC5DA1L4H1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSC5DA1L4H1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSC5DA1L4H1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSC5DA1L4H1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSC5DA1L4H1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SSC5DA1L4H1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSC5DA1L4H1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSC5DA1L4H1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSC5DA1L4H1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSC5DA1L4H1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms