Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
A0A1B0GTW7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms