Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A0J9YXV3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms