Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 MEFV-209ENST00000541159 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 TAF11-202ENST00000420584 1465 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 STPG4-201ENST00000294947 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 DPF2-202ENST00000415073 2085 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AL606760.3-201ENST00000569869 3591 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 ALX1-201ENST00000316824 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 SLC25A6P1-201ENST00000412123 775 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 LINC01678-202ENST00000424921 475 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC012615.6-203ENST00000590531 272 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC009061.2-202ENST00000602596 696 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 FAM114A2-211ENST00000520667 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK8P49336 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 CREB5-203ENST00000396299 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 ZDHHC4-202ENST00000396706 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 KHDC1L-201ENST00000370388 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC139795.1-201ENST00000499314 838 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AL592295.4-201ENST00000636161 997 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 LILRA6-203ENST00000396365 1890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms