Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SYCP3-203ENST00000392927 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AK2-206ENST00000480134 811 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AP001189.3-201ENST00000531511 651 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC103706.1-201ENST00000561761 679 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TMEM147-AS1-204ENST00000590125 698 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC004080.4-201ENST00000602610 633 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 LINC00969-247ENST00000608737 956 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AL358215.3-201ENST00000640695 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATRXP46100 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 KLK8-201ENST00000291726 853 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 RCL1-203ENST00000381732 804 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 NPIPB2-202ENST00000399147 1194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 HNRNPA1P46-201ENST00000411735 937 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 LINC00106-201ENST00000430235 370 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CYP4F60P-201ENST00000439449 549 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 RN7SL614P-201ENST00000461850 280 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 BCRP5-201ENST00000514371 253 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AL391152.1-201ENST00000554160 1111 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC005154.1-204ENST00000580902 926 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CLEC4M-210ENST00000597522 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MIR6750-201ENST00000617817 75 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CENPP-204ENST00000618653 570 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 GOLGA6L22-203ENST00000620691 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PPATP1-201ENST00000496669 1547 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRXP46100 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 HSD17B3-201ENST00000375262 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 FTH1P19-201ENST00000402402 528 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TMEM18-203ENST00000405941 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MT1XP1-201ENST00000421314 186 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MSMP-202ENST00000436428 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 RN7SL748P-201ENST00000483066 311 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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