Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MIR3610-201ENST00000582903 73 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 LINC01907-201ENST00000415174 2609 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC087741.1-201ENST00000570309 4399 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 MPP4-201ENST00000315506 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 MPP4-207ENST00000428900 2320 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ICA1-204ENST00000396675 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 OAS1-201ENST00000202917 1816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ZMYND11-203ENST00000381591 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PCBP2-201ENST00000359282 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 UNC45A-201ENST00000394275 4002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 MARCH5-201ENST00000358935 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PPARD-203ENST00000360694 3747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ZNF792-202ENST00000605484 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PRDM11-204ENST00000530656 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SPDYE8P-201ENST00000333385 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SPDYE11-201ENST00000340073 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 MORC2-AS1-201ENST00000422995 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SPDYE9P-203ENST00000575125 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 COLQ-203ENST00000383788 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SEMA4D-213ENST00000455551 3594 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ZNF559-213ENST00000603380 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PDIA6-208ENST00000617249 2344 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 MAP10-201ENST00000418460 3516 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 NDRG4-203ENST00000394279 3431 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PEX1-204ENST00000438045 3329 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CDNF-202ENST00000378442 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SEMA4A-202ENST00000368282 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CAV1-209ENST00000614113 3201 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 GLYR1-202ENST00000436648 3466 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 EIF4BP7-201ENST00000432307 1813 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 VRK3-202ENST00000377011 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 LRTOMT-207ENST00000435085 3194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 STPG4-201ENST00000294947 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 OSBPL6-206ENST00000409045 3427 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 FAM84A-202ENST00000331243 3765 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 MAP2K6-206ENST00000590474 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 FAM131A-201ENST00000310585 3677 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CDYL-202ENST00000343762 3241 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ATG5-204ENST00000369076 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 LAMB3-202ENST00000367030 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 POLR3H-203ENST00000396504 4176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 IGHMBP2-201ENST00000255078 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PRKCQ-202ENST00000397176 3096 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SMIM15-201ENST00000339020 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TIPARP-202ENST00000461166 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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