Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 UGT1A1-201ENST00000305208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AL121900.1-201ENST00000428285 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 SPATA22-201ENST00000268981 1280 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 NDUFB8-203ENST00000370322 713 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 TCEAL9-201ENST00000372656 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 HLA-DRA-201ENST00000374982 1169 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 ARL4A-202ENST00000396662 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 KRT18P50-201ENST00000404337 1243 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 PSG5-207ENST00000407568 1064 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 LINC01874-201ENST00000427398 510 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 U62317.1-201ENST00000434237 157 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 LAMTOR5-AS1-202ENST00000457535 817 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC011294.1-201ENST00000487094 844 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC008014.1-201ENST00000551503 829 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC002306.1-201ENST00000559614 937 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC010761.4-201ENST00000577325 521 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 MIR3177-201ENST00000578255 82 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CU638689.3-201ENST00000624266 1031 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC011591.2-201ENST00000636637 786 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 APTX-215ENST00000468275 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 MEFV-209ENST00000541159 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 SPATA31C1-202ENST00000602681 1927 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 HIST1H1E-201ENST00000304218 754 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 KRT8P40-201ENST00000392131 563 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 PGAM1P4-201ENST00000397343 750 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 AC245052.2-201ENST00000413723 327 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 LINC01219-201ENST00000418612 722 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 VDAC1P13-201ENST00000447826 859 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 GUSBP1-201ENST00000449061 758 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 Z93930.2-201ENST00000458080 505 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 AC113340.1-201ENST00000475257 636 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 AK2-206ENST00000480134 811 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 SLC10A7-205ENST00000507030 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 AP001453.2-201ENST00000544553 391 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 AC124319.1-201ENST00000576808 653 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 LINC01535-204ENST00000591116 815 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 PINLYP-207ENST00000612042 914 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.59-201ENST00000621376 277 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 TSPAN16-206ENST00000621731 642 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 ILK-216ENST00000627400 111 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 SLC16A1-AS1-207ENST00000627431 1073 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 LINC00680-206ENST00000635948 181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 AC004585.2-201ENST00000624090 1473 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 PRAMEF20-202ENST00000602960 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 HEXA-209ENST00000567159 1582 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 SEMA6A-205ENST00000503865 1678 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 MOG-217ENST00000376891 889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 KRTAP4-2-201ENST00000377726 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 MOG-222ENST00000396701 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 MOG-223ENST00000396704 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 AP001631.1-201ENST00000433840 1052 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 AL928921.1-201ENST00000441033 708 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 AL022313.2-201ENST00000442579 372 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 MOG-233ENST00000494692 958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 RPL34-207ENST00000506397 549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 ATP5G1-209ENST00000514808 359 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 AC110058.1-201ENST00000530389 563 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRMP28827 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms