Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC090825.2-201ENST00000557959 739 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AP005264.6-203ENST00000586882 1050 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 LINC00959-202ENST00000637128 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 MAFTRR-201ENST00000562921 1859 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ZNF101-203ENST00000415784 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 SEC22C-205ENST00000417572 1513 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AC004884.1-201ENST00000393647 319 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 GSTM2P1-201ENST00000405166 654 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 PRADC1P1-201ENST00000412317 525 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AC253536.5-201ENST00000506097 347 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 DERL1-204ENST00000519018 575 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AD000091.1-201ENST00000592379 287 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 MRPL34-206ENST00000602206 603 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 SLC26A5-201ENST00000306312 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ZNF684-203ENST00000372699 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms