Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 MKL1-213ENST00000620651 3757 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 IL12A-AS1-203ENST00000497452 2425 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 L3MBTL1-202ENST00000373134 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 MAGEA11-202ENST00000355220 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 ACAD11-204ENST00000481970 1891 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TRAF6Q9Y4K3 ARHGAP25-201ENST00000409030 2936 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TRAF6Q9Y4K3 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TRAF6Q9Y4K3 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TRAF6Q9Y4K3 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TRAF6Q9Y4K3 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 MRPL27-201ENST00000225969 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 CPSF4-206ENST00000441580 942 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TRAF6Q9Y4K3 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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