Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 UCK1-202ENST00000372210 2051 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 GUCY1B3-207ENST00000513437 2355 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AOX3P-202ENST00000469595 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 LILRA2-204ENST00000391738 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 NDUFAF3-201ENST00000326912 705 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 ZNF343-203ENST00000381253 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AC006450.1-201ENST00000421041 460 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 STYXL1-206ENST00000431581 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 CYP2F2P-201ENST00000437853 1056 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AC004134.1-201ENST00000587835 225 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AP000547.3-203ENST00000591299 751 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AC068620.2-201ENST00000602927 529 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AC012593.1-216ENST00000626183 444 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 LINC01702-203ENST00000635350 745 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 SULT1A4-201ENST00000360423 1390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 CFAP206-202ENST00000369562 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 TYRL-201ENST00000243152 441 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 OR4C46-201ENST00000328188 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 IGLV2-11-201ENST00000390314 400 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AL732414.1-201ENST00000413346 573 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 LINC02054-201ENST00000419960 885 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AL450326.1-201ENST00000442526 760 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 FANCD2OS-204ENST00000450660 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 RN7SL743P-201ENST00000475032 298 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 RPL7AP4-201ENST00000483820 769 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AC020917.1-201ENST00000494084 893 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 KLF3-AS1-205ENST00000507091 642 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 SLC39A9-210ENST00000557046 855 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 MYL4-208ENST00000572316 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AC125494.1-202ENST00000586338 723 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 KRTAP4-9-202ENST00000617453 558 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AL117190.3-201ENST00000621821 87 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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PTPRMP28827 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 COQ10A-203ENST00000546544 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 CRISP2-203ENST00000618917 1492 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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PTPRMP28827 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 PMS2CL-202ENST00000403974 1529 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 SAMMSON-221ENST00000641715 1546 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 TMOD4-201ENST00000295314 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 C1orf94-201ENST00000373374 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AC074389.2-201ENST00000421380 437 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 DICER1-AS1-201ENST00000435343 723 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 BX571846.1-201ENST00000447347 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 CDK2AP2P2-201ENST00000478512 367 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AC020899.1-201ENST00000492855 602 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 GPR79-201ENST00000498175 868 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AC008588.1-201ENST00000514867 462 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AP000842.1-201ENST00000524467 698 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AC113208.2-201ENST00000565381 608 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AC079779.3-201ENST00000588842 1200 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 METTL23-213ENST00000591571 585 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AC099343.2-201ENST00000605082 686 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 FP236383.2-201ENST00000625598 923 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 FP236383.3-201ENST00000627981 923 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 FP671120.3-201ENST00000631211 923 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 TDG-201ENST00000266775 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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