Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 MLN-202ENST00000430124 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 MAP1LC3BP1-202ENST00000438342 516 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 IQCF5-201ENST00000446461 512 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AL592463.1-201ENST00000451108 635 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC025178.1-201ENST00000503441 834 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 HDAC2-AS2-216ENST00000522844 808 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AP001107.8-201ENST00000530805 479 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 RN7SL732P-201ENST00000581157 300 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC090844.3-201ENST00000583462 784 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SARS2-211ENST00000598831 665 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC007728.3-201ENST00000602304 746 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 IGHD-202ENST00000613640 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 LINC01615-203ENST00000634877 673 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ALDH3B2-204ENST00000530069 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ENO3-201ENST00000323997 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC096677.3-201ENST00000413162 387 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC004870.4-202ENST00000433337 455 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 PIN1P1-202ENST00000439639 301 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 RAET1G-203ENST00000479265 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SNORA74.2-201ENST00000516496 180 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC022733.2-201ENST00000520487 531 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 MUTYH-236ENST00000529984 1029 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC018755.1-201ENST00000601315 1182 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 PRIM1-201ENST00000338193 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 NFATC4-212ENST00000554473 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 TRMT61B-201ENST00000306108 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 EFNA1-201ENST00000368406 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC139491.6-202ENST00000637171 2077 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 IGFL4-201ENST00000377697 573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC092100.1-201ENST00000435148 702 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 LINC01664-202ENST00000441544 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 TMX3-202ENST00000443099 913 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 RN7SL148P-201ENST00000467120 279 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC092944.1-204ENST00000475102 384 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC016304.1-201ENST00000476363 413 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AL160313.2-201ENST00000555875 493 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC013472.3-201ENST00000607407 659 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SCHIP1-201ENST00000445224 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 HBD-202ENST00000380299 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 MAS1LP1-206ENST00000419416 1047 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 LINC00106-201ENST00000430235 370 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 LINC00332-201ENST00000455241 834 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 RN7SL225P-201ENST00000464648 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 RPL7AP53-201ENST00000468834 793 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 MTND6P4-201ENST00000506002 522 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC138035.2-201ENST00000509192 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC027290.1-201ENST00000537827 484 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AP000753.1-201ENST00000542805 573 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AL139353.1-202ENST00000547378 474 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 AC011603.2-201ENST00000548149 675 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 BMF-209ENST00000561282 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1SQ13698 MT1G-204ENST00000569500 305 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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