Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TMEM79-202ENST00000357501 975 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 GGNBP1-201ENST00000374458 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC008446.1-201ENST00000522454 451 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AP003469.2-201ENST00000524369 430 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ROM1-205ENST00000534093 862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TCF4-AS1-201ENST00000587660 396 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC007622.2-202ENST00000546714 1680 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AP000487.2-201ENST00000324630 394 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CREB3L4-203ENST00000368601 950 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 IGLV3-22-201ENST00000390307 409 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 NPLOC4-214ENST00000573876 560 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CIRBP-AS1-201ENST00000585832 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AL157392.3-218ENST00000600249 773 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC004832.1-204ENST00000610737 1018 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 GMNN-207ENST00000620958 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AL354704.1-201ENST00000629369 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 NBEAP3-201ENST00000420638 1493 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ATRXP46100 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 APH1B-203ENST00000380343 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC019185.2-201ENST00000424628 520 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 VDAC1P12-201ENST00000451853 882 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CLDN16-202ENST00000456423 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ADPGK-202ENST00000456471 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 RN7SL105P-201ENST00000475661 299 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 RN7SL483P-201ENST00000478417 285 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC091893.1-201ENST00000503772 399 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CLDND1-223ENST00000511081 642 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 WASIR2-201ENST00000527434 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC073655.2-201ENST00000551941 796 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AP000894.2-203ENST00000580612 439 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC005828.4-201ENST00000584608 552 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 LINC00963-211ENST00000608369 961 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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