Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
U3KQA8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
U3KQA8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
U3KQA8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U3KQA8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U3KQA8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
U3KQA8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQA8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQA8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQA8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQA8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQA8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQA8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQA8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQA8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQA8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQA8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQA8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQA8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQA8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQA8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQA8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQA8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQA8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQA8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQA8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQA8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQA8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQA8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQA8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQA8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQA8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQA8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQA8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQA8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQA8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQA8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQA8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQA8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQA8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQA8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQA8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQA8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQA8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQA8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQA8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQA8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQA8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQA8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U3KQA8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U3KQA8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U3KQA8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U3KQA8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U3KQA8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U3KQA8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
U3KQA8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
U3KQA8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U3KQA8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
U3KQA8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQA8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQA8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQA8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQA8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQA8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQA8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQA8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQA8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQA8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQA8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQA8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQA8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQA8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQA8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQA8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQA8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQA8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQA8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQA8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQA8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQA8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQA8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
U3KQA8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
U3KQA8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
U3KQA8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
U3KQA8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
U3KQA8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
U3KQA8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
U3KQA8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
U3KQA8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
U3KQA8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KQA8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KQA8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KQA8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KQA8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KQA8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KQA8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KQA8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KQA8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KQA8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KQA8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms