Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCDHB4Q9Y5E5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCDHB4Q9Y5E5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms