Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP15Q9Y4E8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP15Q9Y4E8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
USP15Q9Y4E8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP15Q9Y4E8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP15Q9Y4E8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP15Q9Y4E8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP15Q9Y4E8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP15Q9Y4E8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP15Q9Y4E8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP15Q9Y4E8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
USP15Q9Y4E8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP15Q9Y4E8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP15Q9Y4E8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP15Q9Y4E8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP15Q9Y4E8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP15Q9Y4E8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP15Q9Y4E8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP15Q9Y4E8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
USP15Q9Y4E8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP15Q9Y4E8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP15Q9Y4E8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP15Q9Y4E8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms