Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC43.11■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC43.1■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
DCAF1Q9Y4B6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC43.07■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC43.07■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC43.04■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC43.01■■■■■ 4.48
DCAF1Q9Y4B6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms