Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q9Y3F1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9Y3F1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms