Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms