Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms