Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRAPPC8Q9Y2L5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms