Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC4Q9Y296 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
TRAPPC4Q9Y296 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms