Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUDCQ9Y266 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms