Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms