Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNRF3Q9ULT6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNRF3Q9ULT6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms