Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLXNB3Q9ULL4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNB3Q9ULL4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNB3Q9ULL4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms