Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALD1Q9ULE6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms