Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP45Q9UL16 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms