Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUF60Q9UHX1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms