Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO40Q9UH90 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms