Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SWAP70Q9UH65 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SWAP70Q9UH65 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms