Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
VTI1BQ9UEU0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTI1BQ9UEU0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms