Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CFDP1Q9UEE9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CFDP1Q9UEE9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms