Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX1-2Q9UD57 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms